В начале 90-х годов прошлого века, когда, после распада Советского Союза, под угрозой оказалась целостность механизма управления государством, руководство Башкортостана сумело быстро создать обновлённую систему властных структур. Так во всех городах и районах республики появились администрации, руководители которых стали подчиняться непосредственно Президенту РБ.

Администрация Агидели

Агидель статус города республиканского подчинения получила 26 марта 1992 года, и сразу же Указом Президента РБ главой Агидельской администрации был назначен Мулланур Валеевич Гильфанов. С сентября 1993 года администрацию возглавляет Валерий Яковлевич Фёдоров. Под его контролем находятся все без исключения процессы, происходящие в Агидели .

Первый заместитель главы администрации Загит Абрарович Гиззатуллин курирует комплекс городского коммунального хозяйства, связь и здравоохранение. Под контролем заместителей главы Ф.С.Абрарова, А.П.Хрущёвой и Ш.И.Биксаева находятся финансы и экономика города, блок социальных вопросов, образование и культура. Слаженность работы коллектива во многом зависит от управляющего делами Татьяны Леонидовны Лаховой. С момента образования дирекции единого заказчика её коллектив возглавляет В.П.Зыкова.