Хирургическое отделение в Агидели берёт своё начало теперь уже в далёком 1991 году. Хотя первую хирургическую помощь, не требующую специального сложного операционного оборудования, агидельцы начали получать в 1985 году, когда на стройплощадку Башкирской АЭС приехал молодой врач-хирург Валерий Рашидович Мамлиев. Кстати, именно он открывал и не один год возглавлял хирургическое отделение. Рассчитанное на 65 коек, хирургическое отделение первоначально включало в себя и гинекологию. Три койки были выделены для палаты интенсивной терапии. Вместе с В.Мамлиевым в то время обогащали уже имеющийся опыт, становились настоящими профессионалами своего дела доктора Р.Акмалов, Г.Хлебцов, Р.Рязапов, Р.Фахретдинов, З.Фаттахова.

В распоряжении современного хирургического отделения Агидельской городской больницы две операционные. Анестезиологическое и реанимационное подразделения, имеются прикроватный монитор "Тритон", диагностическая аппаратура… Не первый год хирургическое отделение возглавляет Радик Зиннурович Акмалов. Под его руководством успешно практикуют заслуженный врач Республики Башкортостан, анастезиолог Р.Рязапов; первоклассные хирурги Р.Хамидуллин и Х.Авзалов; реаниматолог Г.Арсланова, гинеколог Ф.Шамсиев, старшая медсестра С.Валеева. Гордостью отделения по праву считается первый в Агидели кандидат медицинских наук Р.Мусакалимов.